היחידה לגידולי דרכי מערכת העיכול מעניקה טיפולים אונקולוגיים מקובלים למחלות השונות כמו גם טיפולים חדשניים אשר הוכנסו לאחרונה לשימוש בעולם.
היחידה שמה דגש מיוחד על ניסיון ריפוי מלא של חולים עם מחלה גרורתית לכבד או לריאות והיא מובילה כיום בארץ בגישתה חסרת הפשרות במחלה במצב מתקדם, תוך שימוש בתרופות חדשניות שמטרתן הקטנת הגרורות וסילוקן. לשם כך אנו נעזרים בצוות מנתחי כבד בכירים של היחידה לניתוחי כבד ושל המחלקה לכירורגיה כללית ובמנתחי ריאות הבכירים בארץ. בחולים אשר נותחו בהצלחה, היחידה מתרכזת במניעת חזרת המחלה הממארת במסגרת מחקר בינלאומי רב-מרכזי (ראה מטה) לקידום מטרה זו.
בחולים עם מחלת סרטן המעי הגס (או החלחולת) עם מחלה גרורתית אשר אינה מגיבה יותר לתרופות המקובלות, היחידה אימצה שיטה חדשנית של הקרנה ייחודית של הגרורות הכבדיות על ידי צינתור עורק הכבד והזרקת גרגירים רדיואקטיביים המתרכזים באופן מיוחד בגרורות עצמן ומקרין אותן. מחקרים הראו שיפור משמעותי באורך החיים של חולים אשר טופלו בשיטה זו. מאחר והחומר המוזרק אינו כלול בסל הבריאות, עלותו חלה על החולה.